碧山巖位於內湖碧山上。廟內奉祀開閩民族英雄陳元光及其部屬李伯瑤、馬仁兩位將軍。陳元光在唐末開拓福建漳州地方，被視為漳州人守護神，並尊稱「開漳聖王」。碧山巖是臺灣最大開漳聖王廟，香火鼎盛。傳說漳州府人士黃某攜眷渡海來臺拓墾時，見此地為難得一見之吉地，故將隨身佩帶香火懸掛於石洞膜拜後離去。而後山下一帶盜匪猖獗，打家劫舍使得該處民不聊生，西元1751年，盜匪正打算攻頂時，忽見山頂鋒芒四射，戰鼓齊鳴，原來是當時所懸香火之神石1分為3，中塊乃聖王，而兩邊石塊則為李、馬兩將軍，周圍散石滾落山下，使得匪徒棄械逃亡。附近居民聞訊至此膜拜，果然神靈賜福，於是興建石室小廟。後因香客漸眾，原石室小廟不敷大批香客膜拜，故在原址另建本殿。而後發生數次的天災，經過數次的整修後，在多數地方人士、信徒及寺廟管理委員的努力下，擴建至如今。
碧山巖居高臨下，除俯瞰臺北盆地外，站在廟前平台更可見蜿蜒的淡水河，鯉魚山及梯田等等，水光山色相互呼應。而夜間時臺北101大樓、圓山大飯店等夜景之美盡收眼簾。